Validación del modelo de regresión binaria BBB

En la literatura estadística varios modelos de regresión binaria, abordados desde el punto de vista de la Inferencia Bayesiana, han sido propuestos, muchos de los cuales se encuentran aún en estudio, para una posterior validación y aceptación, como el propuesto por Bazán, Bolfarine y Branco, denominado BBB Skew Probit. Este tipo de inferencia estadística se basa en simulaciones Monte Carlo con Cadenas de Markov, las cuales se basan en cálculos vía simulación muy complejos, donde el diseño de la simulación se realiza para un número elevado de casos, siendo el recurso computacional fundamental para su resolución. El tiempo requerido para este tipo de simulaciones es muy extenso, aún con ayuda de una computadora de última generación. R-project ( Blog DIA)

Física GAE1 NuCav (Grupos de Altas Energías)

Consiste en la comparación de dos modelos de producción de neutrinos de alta energía en Núcleos de Galaxias Activas (NGA), a través de la variación de los valores de los parámetros involucrados en la definición de cada modelo. El programa calcula el número de neutrinos producidos por cada modelo y el número de éstos que serán detectados en el telescopio de neutrinos IceCube, ubicado en el Polo Sur. Estos datos simulados serán utilizados posteriormente para cuantificar, primero, la posibilidad de identificar los neutrinos provenientes de núcleos activos de los neutrinos de acuerdo a cada modelo, y, segundo, la capacidad que tendría IceCube para saber cual de los dos modelos es el que explica la producción de neutrinos

Física GAE1 NuCav Mult (Grupo de Altas Energías)

Una continuacíon del proyecto Física GAE1 NuCav con la opción de enviar multiples tareas a la vez. ( MIT Technology Review: How neutrino beams could reveal cavities inside earth)

Física GAE1 NuCav (Grupos de Altas Energías)

Proyecto para el grupo de altas energías, el cual está trabajando en simular la performance del sistema de subdetectores AD, que se está construyendo para estudiar física difractiva en ALICE. Para ello se ha analizado la eficiencia de estos subdetectores de en el proyecto ALICE el cual es uno de los cuatro experimentos donde se producen las colisiones de los haces de protones e iones pesados, que son acelerados en el Large Hadron Collider. Este se encuentra en el CERN (the European Organization for nuclear research) en la frontera franco-suiza. La meta principal del programa de física de ALICE es recrear y medir las propiedades del plasma de quarks y gluones que se produjo pocos instantes después del Big Bang. Estos resultados nos deberían ayudar a entender el fenómeno de confinamiento (y deconfinamiento), que se da en el contexto de la cromodinámica cuántica (fuerza entre los quarks mediada por los gluones). Otro de los objetivos de ALICE es tratar de identificar y estudiar eventos de física difractiva. ( Boletín NEO PUCP Año 5 Nro 55 - Somos la única institución en el Perú que es colaboradora ofcial del CERN )

Educast

Educast PUCP es una plataforma de difusión de contenido multimedia relacionados a eventos institucionales y académicos. Para poder llegar a más usuarios en todo el mundo es necesario que los vídeos estén disponibles en distintos formatos (OGG, MP4) y calidades (SD, HD). Utilizando Legión PUCP, se ha podido optimizar los tiempos de conversión de vídeos, aprovechando el envío simultáneo de “unidades de trabajo de conversión”. Los encargados de edición suben los archivos de vídeo en formato FLV o MOV, el sistema envía la tarea de conversión y monitorea el progreso. Legión envía el vídeo convertido a una ruta específica, donde se sube el nuevo formato. Finalmente se notifica por correo a los encargados si la tarea fue concluida con éxito o se encontró algún error.(http://educast.pucp.edu.pe/)

AutoDock (Química)

El proyecto permite la ejecución de simulaciones de modelamiento molecular mediante el software Autodock4. (http://autodock.scripps.edu/)

Gromacs (Química)

El proyecto permite la ejecución en Legión de el software Gromacs, el cuál la ejecución de simulaciones de dinámica molecular de sistemas con cientos de millones de partículas mediante el software Gromacs, este fue originalmente desarrollado en la Universidad de Groningen, pero por ser de código abierto ha sido reimplementado por muchos otros desarrolladores. algún error.

Games (Química)

El proyecto permite la ejecución en Legión de el software Gamess, el cuál permite la ejecución del programa de software de química computacional llamado GAMESS (US) General Atomic and Molecular Electronic Structure System.

CRPROPA (Grupo de Altas Energías)

Genera una lista de deflecciones de rayos cósmicos de ultra alta energia bajo la influencia del modelo JF12 del campo magnético galáctico. Se realizan multiples deflecciones para distintas energias de rayos cósmicos, múltiples direcciones de llegada y varias realizaciones de las componentes aleatorias del campo magnético galáctico.

MCICSignal (Grupo de Altas Energías)

El proyecto inyecta eventos de señal en el cielo, con la finalidad de generar data falsa en el observatorio de IceCube. Para un conjunto de posiciones fijas en el mapa galáctico, que actúan como fuentes de neutrinos, el programa realiza la convolución de las áreas efectivas del experimento con el flujo de neutrinos de la fuente. A su vez, el programa incorpora efectos de resolución angular de la fuente.

MCBackground (Grupo de Altas Energías)

El proyecto tiene como fin generar una muestra de eventos de background a partir de la data del observatorio de IceCube. Recibe como entrada las direcciones de llegada de los neutrinos (en coordenadas ecuatoriales) y procede a generar muestras de background.

ICBacktrack (Grupo de Altas Energías)

El código recibe dos conjuntos de puntos en el espacio, el primero corresponden a eventos de neutrinos y el segundo contiene direcciones de llegada de rayos cósmicos. Usando el método de backtracking, el código calcula la probabilidad que los rayos cósmicos provengan de una vecindad de alguno de los eventos de neutrinos..

EqReacDifusion 2D (Inestabilidades de un frente de propagación de una reacción-difusión en dos dimensiones para tubos rectangulares)

Se analiza la estabilidad de la propagación de los frentes de reacción en las diferentes difusividades que conducen a una inestabilidad de las soluciones de frentes planos. Consideramos que los sistemas donde el término reacción consiste en una reacción auto catalítica cúbica. Se introduce perturbaciones de longitudes de onda fijas frente a la solución, obteniendo así la tasa de crecimiento de la perturbación. Inestabilidades aparecen para una serie de perturbaciones con la tasa de crecimiento positivo. Este análisis demuestra una vez más que hay una relación de densidad crítica para la difusividad de diferentes especies. También llevamos a cabo un cálculo de diferencias finitas de las ecuaciones no lineales en forma general, mostrando frentes curvos que se propagan con velocidad constante en dominios bidimensionales. Los frentes se comportan como planos y/o curvos. Donde los frentes curvos toman comportamientos caóticos que será necesario caracterizar. Los sistemas de reacción-difusión se aplican a la modelización de procesos tanto químicos como dinámicos de naturaleza no química. Encontramos ejemplos de tales aplicaciones en biología, geología, física y ecología. Matemáticamente, los sistemas de reacción-difusión tienen la forma de ecuaciones parabólicas en derivadas parciales.

AmberTools (Química)

El proyecto permite la ejecución en Legión de Ambertools 15, este es una suite que se puede utilizar para llevar a cabo completas simulaciones de dinámica molecular. Tiene entre sus motores de simulación sander (más tradicional, permite simulaciones utilizando la transformada rápida de Fourier)

R-project - Comparacion de modelos bayesianos para la estimación de la prevalencia de enfermedades cuando las pruebas diagnósticas estan sujetas a error de clasificación

La estimación de la prevalencia es una tarea sencilla si se cuentan con pruebas diagnósticas 100% exactas. Sin embargo, en muchos casos lo que ocurre es que no existen pruebas exactas o en algunos casos resultan muy costosas. Ante este problema, se pretende utilizar dos modelos bayesianos que toman en cuenta el margen de error de las pruebas diagnósticas con el fin de obtener mejores estimaciones de la prevalencia. En este proyecto, estamos realizando simulaciones para comparar el performance de los dos modelos bajo diversos escenarios. Debido a la cantidad de simulaciones que se pretenden realizar, Legión ayuda a realizar estos trabajos de manera más eficiente

RSTAN (Estadística)

La investigación tiene por objetivo utilizar la distribución beta inflacionada en un modelo de regresión a la media con efectos mixtos desde una perspectiva bayesiana, con lo cual es posible modelar directamente la media de variables aleatorias que pueden tomar valores en el intervalo cerrado [0,1] utilizando datos longitudinales o datos agrupados.

Vegas (Grupo de Altas Energías)

El proyecto buscó entender el impacto de la desintegración de neutrinos en experimentos de oscilación. El análisis completo de dicho escenario requería la variación de seis parámetros, es decir, la generación de un grid de seis dimensiones. Para cada elección de parámetros, se generó una predicción experimental, que luego se comparó con los datos observados. Los resultados llevaron a un artículo, que ha sido enviado a una revista indizada. El artículo se puede encontrar aquí: https://arxiv.org/abs/1705.03074

MadGraph (Grupo de Altas Energías)

La presencia de neutrinos masivos podría afectar la fenomenología de modelos supersimétricos. Dicha fenomenología se presenta en colisionadores de protones, que son simulados por los programas MadGraph y Pythia. No obstante, dicha simulación puede demorar mucho tiempo, lo que complica el panorama cuando uno quiere considerar distintas realizaciones del modelo. Luego de la implementación de ambos programas en LEGION, se generaron las predicciones experimentales buscadas. Los resultados llevaron a un artículo, que ha sido enviado a una revista indizada. El artículo se puede encontrar aquí: https://arxiv.org/abs/1705.06583